Nederlandse naam: Laboratorium voor Bioinformatica en Ecosysteembiology
Overkoepelend instituut: KU Leuven; Rega-instituut; Department of Microbiology and Immunology (KULeuven), meer
Adres:
Herestraat 49
box 1028
B-3000 Leuven
België
| |
Type: Wetenschappelijk
|
1 Directeur: Hoofd van de onderzoeksgroep/afdeling 2 Mariene onderzoeker: Is werkzaam in deze groep en treedt op als (co)auteur in minstens één mariene publicatie in de laatste 5 jaar. 3 Gespecialiseerd personeel: Levert administratieve of technische ondersteuning aan het zeewetenschappelijk onderzoek.
| Voormalig geassocieerde persoon |
|
|
| Abstract: |
Het Raes lab combineert grootschalige next-generation sequencing met nieuwe computationele benaderingen om het functioneren en de variabiliteit van microbiële gemeenschappen te onderzoeken. Daarnaast richt het lab zich op het ontwikkelen van computationele methodes voor de analyse van (next-generation) sequence data en het onderzoek van eigenschappen van gemeenschappen aan de hand van metagenomica, transcriptoomstudie en meta-metabolomics data, die vervolgens toegepast worden in verschillende omgevingen (oceanen, bodem, etc.).
Het marien onderzoek van het lab richt zich op vergelijkende metagenomica en de transcriptoomstudie van oceanische planktongemeenschappen gaande van virussen tot larven van vissen. Dit onderzoek maakt eveneens deel uit van het Laboratorium voor Bioinformatica en Ecosysteembiologie van het VIB. |
| Publicaties (2) |
Top | Personen |
( 2 peer reviewed ) opsplitsen filter
 Carradec, Q.; Pelletier, E.; Da Silva, C.; Alberti, A.; Seeleuthner, Y.; Blanc-Mathieu, R.; Lima-Mendez, G.; Rocha, F.; Tirichine, L.; Labadie, K.; Kirilovsky, A.; Bertrand, A.; Engelen, S.; Madoui, M.-A.; Méheust, R.; Poulain, J.; Romac, S.; Richter, D.J.; Yoshikawa, G.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Searson, S.; Tara Oceans Coordinators; Jaillon, O.; Aury, J.-M.; Karsenti, E.; Sullivan, M.B.; Sunagawa, S.; Bork, P.; Not, F.; Hingamp, P.; Raes, J.; Guidi, L.; Ogata, H.; de Vargas, C.; Iudicone, D.; Bowler, C.; Wincker, P. (2018). A global ocean atlas of eukaryotic genes. Nature Comm. 9(1): 13 pp. https://dx.doi.org/10.1038/s41467-017-02342-1, meer- Guidi, L.; Chaffron, S.; Bittner, L.; Eveillard, D.; Larhlimi, A.; Roux, S.; Darzi, Y.; Audic, S.; Berline, L.; Brum, J.R.; Coelho, L.P.; Ignacio-Espinoza, J.C.; Malviya, S.; Sunagawa, S.; Dimier, C.; Kandels-Lewis, S.; Picheral, M.; Poulain, J.; Searson, S.; Tara Oceans Consortium Coordinators; Stemmann, L.; Not, F.; Hingamp, P.; Speich, S.; Follows, M.; Karp-Boss, L.; Boss, E.S.; Ogata, H.; Pesant, S.; Weissenbach, J.; Wincker, P.; Acinas, S.G.; Bork, P.; de Vargas, C.; Iudicone, D.; Sullivan, M.B.; Raes, J.; Karsenti, E.; Bowler, C.; Gorsky, G. (2016). Plankton networks driving carbon export in the oligotrophic ocean. Nature (Lond.) 532(7600): 465-470. https://hdl.handle.net/10.1038/nature16942, meer
|
|
